KCN Hưng Phú 1 (diện tích 262ha) và KCN Hưng Phú 2 (tổng diện tích 212ha) đều gặp khó khăn ở công tác bồi hoàn, giải tỏa, tái định cư. Tại KCN Hưng Phú 1, trong ba năm qua từ khi chuyển chủ đầu tư cho Công ty CP KCN Sài Gòn - Cần Thơ đến nay công tác giải phóng mặt bằng chưa đạt 50ha; công tác san lấp mặt bằng, thi công hạ tầng gặp khó khăn do đền bù giải tỏa không đồng bộ.

Xung quanh vấn đề chậm tiến độ thực hiện các dự án xây dựng hạ tầng KCN Hưng Phú 1 và Hưng Phú 2, Phó chủ tịch UBND TP Cần Thơ Nguyễn Thanh Sơn cho rằng: “Nhà đầu tư xây dựng các KCN Hưng Phú chưa quan tâm nhiều đến dự án, còn trông đợi vào sự đột phá của TP như hoàn thành cầu Cần Thơ, sân bay Trà Nóc và cảng Cái Cui. Các sở, ngành chưa làm hết trách nhiệm, chưa quan tâm tháo gỡ khó khăn cho nhà đầu tư. Chính quyền địa phương chưa phối hợp tốt với nhà đầu tư, nhất là trong công tác giải phóng mặt bằng”...