Theo quy hoạch do Chính phủ phê duyệt ngày 10/11, đến năm 2020, Cảng Hàng không Quốc tế Phú Quốc sẽ xây một đường cất hạ cánh đảm bảo tiếp nhận máy bay B767, B747-400 và một sân đỗ máy bay đáp ứng 14 vị trí đáp ứng được từ 25-27 vị trí đỗ.

Dự kiến đến năm 2020, nhà ga hành khách sẽ đáp ứng đủ công suất 2,5 triệu khách một năm, đến năm 2030 lượng hành khách tiếp nhận là 7 triệu lượt hành khách. Nhà ga hàng hóa có công suất đạt 8.600 tấn hàng hóa quốc tế và 5.700 tấn hàng hóa nội địa. Giai đoạn 2030, tổng lượng hàng hóa tiếp nhận lên tới 27.600 tấn một năm. Tổng diện tích toàn sân bay là hơn 900 ha.

Để phục vụ hoạt động của sân bay, đường ra vào sân bay được nối với đường 46 của đảo Phú Quốc, mỗi chiều 2 làn xe và có thể mở rộng trong tương lai.