Đây là nhà máy đựoc xây dựng theo công nghệ Seen-Urenco theo nguyên lý hóa sinh, gồm 14 hạng mục, như hệ thống tách rác, thu gom nước rác; bể điều hòa; cụm xử lý khí ni-tơ, cụm xử lý sinh học, bể phản ứng sinh học hiếu khí, bể lắng thứ cấp, phân hủy bùn sinh học, bề khử trùng sau xử lý…Nhà máy được điều hành bằng hệ thống tự động hóa tại trung tâm điều khiển, bao gồm trung tâm PLC và phần mềm Scada, hệ thống máy tính, panel hiển thị, các thiết bị đo tại hiện trường…
 

Phó tổng giám đốc Công ty Môi trường đô thị Nguyễn Xuân Hưng, cho biết cùng với Nhà máy số 1 (xây dựng năm 2005), việc mở cửa Nhà máy xử lý nước rác số 2 này đã nâng công suất của khu liên hợp xử lý nước rác tập trung lên 1.500 m 3 /ngày đêm, tăng gấp 2 lần trước đó.