Là cơ quan trực thuộc UBND tỉnh Bình Phước, Ban Quản lý thực hiện chức năng quản lý nhà nước trực tiếp đối với các khu công nghiệp, khu kinh tế cửa khẩu trên địa bàn tỉnh.

Bên cạnh đó, Ban Quản lý chịu trách nhiệm quản lý và tổ chức thực hiện chức năng cung ứng dịch vụ hành chính công, dịch vụ hỗ trợ khác liên quan đến hoạt động đầu tư và sản xuất, kinh doanh cho nhà đầu tư trong các khu công nghiệp, khu kinh tế cửa khẩu trên địa bàn.         

Ban Quản lý là đầu mối kế hoạch ngân sách tỉnh, được cân đối riêng vốn đầu tư phát triển từ nguồn ngân sách trung ương. Kinh phí quản lý hành chính nhà nước, kinh phí hoạt động sự nghiệp của Ban Quản lý do ngân sách nhà nước cấp theo quy định.

Về cơ cấu tổ chức, Ban Quản lý có Trưởng Ban và không quá 3 Phó Trưởng ban.